资源与环境专业学位硕士研究生培养依托环境科学与工程学科建设，2021年获得学位点授权，2022年开始招生专业型硕士研究生，设置高原湖泊流域污染物环境行为与污染防治、土壤环境治理与修复、农林产品质量安全与环境健康、典型生态系统保护与修复等特色方向。研究方向紧扣云南及国家面临的高原湖泊流域水污染过程及治理、土壤污染修复等生态环境问题，在西南地区具有明显的学科特色和优势。
资源与环境学科现有专任硕士研究生导师37人（院内20人），行业研究生导师24人。拥有云南省科技创新团队、云南省环境污染与食品安全及人体健康创新团队和云南省高校博士、硕士导师团队，形成了相对稳定的研究方向及研究队伍。在国家高原湿地研究中心支持下，依托云南省高原湿地保护修复与生态服务重点实验室、国家林业和草原局云南滇池湿地生态系统国家定位观察站、云南生态文明建设工程技术研究中心、昆明市保护地生态文明建设工程技术研究中心等国家、省级和市级平台。近5年来承担省部级以上的科研项目40余项，其中国家自然科学基金项目20余项。
