国家高原湿地研究中心先后获国家、云南省及西南林业大学科研平台建设经费3000余万元。拥有全自动激光粒度仪(HORIBA LA-960S)、藻类自动分类仪(WALZ phyto-pam)、三重四级杆质谱仪(TSQ Endura)、碳同位素分析仪(Picarro TOC-CRDS )、液相色谱仪(UltiMate 3000)、全谱直读电感耦合等离子体发射光谱仪（ICP）(ICPE-9820)等专业科研仪器设备共计675台/套，总价值约2690余万元。目前建成“分子实验室、微生物实验室、环境分析实验室、湿地生态学实验室、元素分析室、色谱分析室”等多个现代化专业实验室，专业实验室面积共计约1245 m2。
1. 控制环境生长室系统
主要用于全球气候变化对植物物候及生长的影响。主要控制因子包括：二氧化碳浓度、温度。
北京易盛泰和 LT/ACR-2002
2. 环境微生物菌种鉴定和群落变化分析系统
系统以碳源利用率为原理，可鉴定包括细菌、酵母和丝状真菌在内总计 2650 种微生物，范围包括人类、动物和植物病原菌以及食品和环境微生物，具体包括： 1）数据库 1327 种， 其中包含 GN 细菌 568 种，GP 细菌 759 种；GN 和 GP 细菌实现在一块鉴定板完成鉴定；GenIII 鉴定板底物不仅包含 71 种碳源， 还包含 23 种化学物灵敏性测试，利用细胞表型测试原理，不仅增强了对鉴定 菌株的扩展性，也增加了鉴定灵敏性，同时使准确性进一步提升；2）厌氧菌 361 种，鉴定需时间 20-24 小时；3）酵母菌 267 种，鉴定需时间 24-72 小时； 4）丝状真菌 708 种，鉴定所需时间 72 小时或以上。
美国 Biolog GENIIIMicroStationSystem 型
3. 土壤氮循环监测系统
在密封、充气、有压力的恒温系统中放置通气良好的土样，通过记录系统中O2 ，CO2，气压、温度等参数，即时得到土壤硝化速率、反硝化速率和土壤 呼吸速率，内置测量室环境测量单元，监测反应环境温度、气压等参数。
德国 UMS BaPS 100-S
4. 植物生理生态监控系统
用于监测气温、相对湿度、总辐射、 CO2 浓度、土壤各类因子（土壤温度、 土壤水分含量、土壤盐分）及植物 生长系数、光合参数。
澳大利亚 DT Eco-watch
5. 生物与环境离子信息检测分析系统
对整体或分离后的样品不造成损伤的情况下， 对分子 / 离子：Ca2+、H+、K+、Na+、NH4+、NO3–、Cd2+、Mg2+、CL–、O2 、H2O2 等进行检测。
旭月 ( 北京 ) NMT100-IM-XY
6. 地物光谱测量系统
用来测量地表沉积物、土壤、植物、水体和人工目标在 350-2500 nm波段 范围的反射率和透过率，利用探测到的地物吸收特征对目标进行成分识别，并定量化地物的化学组分。软件内置有 USGS 光谱数据库，可用于矿物光谱的匹配。
美国SEI SR2500
7. 便携式光合作用测量系统
在实验过程中控制叶片周围的CO2浓度、光照强度和叶室温度等所有相关的 环境条件，同时测量植物叶片的光合速率、蒸腾速率和呼吸参数等指标。
美国 Li-COR Li-6400XT
8. TOC 总有机碳分析仪
对固体样品和液体样品中的总有机碳（TOC）、总无机碳（TIC）进行分析测定。适用于超纯水（医药用水），饮用水，工业废水，悬浮液甚至是极 难分析的固体样品矩阵的 TOC分析。
德国元素Vario
9. 连续流动分析仪
用于液体样品中氨氮、硝态氮、亚硝态氮、总氮、磷酸盐、总磷等指标的分析检测
德国 SEAL Analytical AA3
10. 温室气体分析仪
采用光谱扫描技术和光腔衰荡光谱技 术 (WS-CRDS)， 同 步 测 量 CO2 、 CH4 和 H2O 浓度， 测量有效路径可 达 20 km。
美国 Picarro G2301
11. N2O/CO 超痕量气体分析仪
采用激光光谱技术，高精度、快速测量氧化亚氮、一氧化碳和水汽浓度。分析仪不受大气中其他气体干扰，也不受大气压变化的影响。该仪器包含内置计算机，可存储数据到其硬盘中，用于实验室或野外长期自动监测。
美国 LGR 907-0015-1000
12. 液相色谱仪
用于液体样品中不稳定和非挥发性的、 离解的和非离解的以及各种分子量范围 的有机物的分离及定性、定量分析。
赛默飞世尔 UltiMate 3000
13. 藻类自动分类仪
对水样中的蓝藻、绿藻、硅 / 甲藻进行自动分类，并分别测量它们的叶绿素含 量和光合活性（调制叶绿素荧光）；可自动测量水样中蓝藻、绿藻和硅 / 甲 藻的叶绿素a含量（定量）和总叶绿a含量。
德国 WALZ phyto-pam
14. 液相色谱 – 质谱联用仪
赛默飞世尔 UltiMate 3000+ 赛默飞世尔 TSQ Endura
15. 碳同位素分析仪
用于固体和液体、有机和无机、 DOC 和 DIC 等样品的碳含量和碳 同位素 δ13C 比率测量。 它是分 别采用燃烧及酸解模块将有机碳或 碳酸盐转化为CO2 ，再用激光光谱 仪主机同步测量CO2 、H2O 浓度和 CO2 同位素 δ13C 比率，精度值：δ13C ≤ 0.3‰。
美国 Picarro TOC-CRDS
16. 全自动激光粒度仪
通过米氏散射理论，测量各种固态颗粒、雾滴、气泡及任何两相悬浮颗粒状物质的粒度分布、测量运动颗粒群的粒径分布。
日本 HORIBA LA-960S。
17. 生物显微镜
用来生物切片、生物细胞、细菌以及活体组织培养、流质沉淀等的观察和研究，同时可以观察其他透明或者半透明物体以及粉末、细小颗粒等。仪器配备了LED 照明系统、荧光装置及观测拍照的数字式摄像机。
德国徕卡 Leica DM6B
18. 水下声纳探测器
基于水体超声回声反射原理，探测鱼类的数量、分布、推断鱼类的大小及生 物量。探测沉水植被的分布、覆盖度和冠层高度。基于聚类方法，对水体的 底质进行划分（泥、沙、岩），测量水深。
美国 BioSnics DT-X 型
19. 全自动核酸提取仪
对全血、白细胞、外周血、单核细胞、培养细胞、组织、石蜡包埋组织切片、体液、拭子、粪便、尿液、痰液、食品、植物等样本进行核酸提取纯化，应用于全自动分离纯化 DNA、RNA、mRNA 和总核酸（PCR 级纯度），并 能配置 PCR 反应体系进行后续下游实验。
瑞士罗氏 MagNA Pure LC
20. 全谱直读电感耦合等离子体发射光谱仪
采用电感耦合等离子体作光源，用于元素的定性与定量分析。
日本岛津 ICPE-9820
21. 气质联用仪
用于分离及定性、定 量分析液体样品中， 热不稳定和非挥发性 的、离解的和非离解 的以及各种分子量范 围的有机物。
赛默飞世尔 气相色谱仪+TRACE1310 质谱仪 ISQ-LT
22. 酶标仪
用于：ELISA/EIA；核酸定量 UV(260/280)； 细胞增殖/细胞毒性；动力学法 ELISA/ 酶学分析； IC50/LD50；β- 半乳糖苷酶报告基因； 蛋白定量分析；NAD(P)H 相关检测；血小板凝集试验；内毒素检测；微生物鉴定。
美国 MD SpectraMax Plus 384
23. 聚合酶链式反应仪 ( 荧光定量 )
用于基因表达分析研究，对目的基 因的定量分析， 进行 SNP 单核苷 酸多态性和突变位点的分析检测。
瑞士罗氏 LightCycler480 Ⅱ
24. 根系生态监测仪器
系统通过非破坏的原位测量，不变 形线性扫描，扫描监测土壤中活体根系的生长动态， 定点、连续观测根系在整个生长季中的动态变化，应用专业根系分析软件分析根系长度、直径、截面积、投影面积、根尖数等参数。
美国 CID CI-600 型
25. 便携式光合作用仪
在实验过程中可以控制叶片周围的 CO2浓度、H2O 浓 度、相对湿度、光照强度和叶室温度等所有相关的环境 条件，同时测量植物叶片的光合速率、蒸腾速率和呼吸参数等指标。
美国 LICOR LI-6800
26. 微波消解仪
由微波消解仪主机、24 位微波消 解转子、全罐压力监控系统、红外 测温系统、智能程序控制系统，用 于水、污水、淤泥、植物材料、土壤、 生物材料、食品等样品的消解，为 原子吸收、等离子体发射光谱、气 质联用、气相色谱等仪器制备样品。
奥地利安东帕 Multiwave PRO
